М.К. Сапарбаев родился в 17 октября 1961 в г. Нукусе Кара-Калпакской АССР в семье инженера-геолога. В 1979 г. Мурат поступил на биологический факультет Казахского государственного университета им. С.М. Кирова. Он специализировался по микробиологии и его научным руководителем на кафедре стала профессор Майя Хажетдиновна Шигаева. Для проведения исследований по курсовой, а затем дипломной работе Мурат Сапарбаев был направлен научным руководителем в Новосибирский государственный университет (НГУ). После успешной защиты дипломной работы в мае 1984 г. он стажировался в течение двух лет в НГУ под руководством профессора Р.И. Салганика и кандидата биологических наук А.В. Мазина, а затем с 1987 г. обучался в г. Новосибирске в аспирантуре Института цитологии и генетики (ИЦиГ). В лаборатории молекулярной биологии под руководством кандидата биологических наук А.В. Мазина и доктора биологических наук Г.Л. Дианова Мурат Сапарбаев выполнил диссертационную работу на тему «Молекулярные механизмы мутаген-стимулируемой рекомбинации у плазмид в штаммах кишечной палочки К12», которую успешно защитил в мае 1991 г. на ученую степень кандидата биологических наук по специальности 03.00.15 - Генетика. К этому времени молодой ученый опубликовал ряд статей в зарубежных научных журналах, чем вызвал интерес у доктора Жака Лаваля из лаборатории «Репарация ДНК» Института Густава-Рози (г. Вильжуиф, Франция), который пригласил Мурата Сапарбаева на постдокторскую позицию. С сентября 2000 г. Мурат Сапарбаев избран заведующим лабораторией «Репарация ДНК» Института Густава-Рози. В настоящее время Мурат Сапарбаев успешно руководит лабораторией «Репарация ДНК», основными научными направлениями которой являются молекулярные механизмы, поддерживающие стабильность генома и дефекты, приводящие к старению и раковым заболеваниям.
Результаты проводимых исследований имеют высокую научную значимость, что позволило их опубликовать в более чем 50 научных статьях в рейтинговых научных журналах, таких как Proceedings of the National Academy of Sciences of the U.S.A.), Natura, Science. На Мурата Сапарбаева (Saparbaev М.) в поисковой системе Google (http://www.google.com ) можно найти более 8000 ссылок.
Мурат Сапарбаев – большой патриот своей Родины и КазГУ, он активно участвует в подготовке докторов PhD, магистров, предоставляет для проведения исследований свою лабораторию, консультирует, читает лекции на факультете биологии и биотехнологии в Казахском национальном университете им. аль-Фараби, в Евразийском национальном университете им. Л.Н. Гумилева и в Назарбаев Университете.